La Asociación Física Argentina ha instituido el Premio Juan José Giambiagi destinado a reconocer una labor sobresaliente en la realización y aprobación, en el país, de una tesis doctoral en física.
Corresponde asignarlo los años pares a una tesis doctoral en física experimental y los años impares a una tesis doctoral en física teórica. En todos los casos la tesis debe ser defendida durante los dos años inmediatamente anteriores al de la edición del premio.